14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2533 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2533  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  392  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.897516  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1463  glutamyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 
194 aa  186  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10460  conserved hypothetical protein  45.18 
 
 
201 aa  174  9e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.153983  normal  0.153126 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4626  hypothetical protein  44.68 
 
 
194 aa  174  9e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1802  hypothetical protein  48.95 
 
 
216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.173014  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4110  hypothetical protein  41.75 
 
 
198 aa  167  9e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.932405  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2342  hypothetical protein  45.69 
 
 
198 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.723886  normal  0.387006 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0970  hypothetical protein  47.67 
 
 
201 aa  160  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.199234 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0634  hypothetical protein  39.18 
 
 
199 aa  154  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0157  hypothetical protein  36.84 
 
 
194 aa  147  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0111  hypothetical protein  43.41 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3535  glutamyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260305  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2333  hypothetical protein  45.78 
 
 
187 aa  138  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0691639  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2784  hypothetical protein  37.95 
 
 
200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000283407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>