16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0642 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_3744  chorismate mutase, putative  98.23 
 
 		 1266 bp  1457    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117732  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0470    97.04 
 
 		 2052 bp  2113    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0097    100 
 
 		 4365 bp  2413    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0169    100 
 
 		 2511 bp  2415    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0171    100 
 
 		 1962 bp  2413    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0642    100 
 
 		 2511 bp  4978    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0765    100 
 
 		 1764 bp  2416    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.460352  normal  0.362308 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2563    100 
 
 		 2139 bp  2413    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000133274  hitchhiker  0.00000122058 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3013    100 
 
 		 1845 bp  2416    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.187136 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3219    100 
 
 		 3906 bp  2415    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3605    100 
 
 		 1797 bp  2413    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4105    100 
 
 		 3189 bp  2413    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4395    100 
 
 		 3123 bp  2413    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00345264  decreased coverage  0.00443856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0442  hypothetical protein  100 
 
 		 1851 bp  58  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0563  hypothetical protein  100 
 
 		 279 bp  50.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0588  hypothetical protein  100 
 
 		 279 bp  50.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.846255 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>