20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0470 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0169    97.04 
 
 
2511 bp  2113    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4395    97.04 
 
 
3123 bp  2115    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00345264  decreased coverage  0.00443856 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4105    97.05 
 
 
3189 bp  2121    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3605    97.04 
 
 
1797 bp  2113    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3219    97.04 
 
 
3906 bp  2113    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3013    97.04 
 
 
1845 bp  2115    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.187136 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2563    97.04 
 
 
2139 bp  2113    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000133274  hitchhiker  0.00000122058 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0765    97.04 
 
 
1764 bp  2113    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.460352  normal  0.362308 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0642    97.04 
 
 
2511 bp  2113    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0171    97.05 
 
 
1962 bp  2119    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0097    97.04 
 
 
4365 bp  2113    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0470    100 
 
 
2052 bp  4068    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1874  hypothetical protein  83.23 
 
 
822 bp  101  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000344156  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1855  hypothetical protein  88.76 
 
 
828 bp  97.6  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1801  hypothetical protein  88.04 
 
 
828 bp  95.6  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2075  hypothetical protein  86.96 
 
 
828 bp  87.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2176  hypothetical protein  85.87 
 
 
828 bp  79.8  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0442  hypothetical protein  100 
 
 
1851 bp  58  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0588  hypothetical protein  100 
 
 
279 bp  48.1  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.846255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0563  hypothetical protein  100 
 
 
279 bp  48.1  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>