26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2905 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2905  phage virion morphogenesis protein  100 
 
 
154 aa  317  3e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00409372  normal  0.452389 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3489  phage virion morphogenesis protein  43.54 
 
 
154 aa  111  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3182  phage virion morphogenesis protein  41.61 
 
 
149 aa  107  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0850838  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3299  phage virion morphogenesis protein  41.18 
 
 
155 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.546085  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4375  phage virion morphogenesis protein  40.27 
 
 
155 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000468393 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1340  phage virion morphogenesis protein  37.25 
 
 
155 aa  98.2  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01352  phage virion morphogenesis protein  38.26 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.981003  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1928  tail completion-like protein  38.41 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.789532 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4335  phage virion morphogenesis protein GpS  38.67 
 
 
150 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.016595 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1389  phage virion morphogenesis (putative tail completion) protein  42.57 
 
 
152 aa  93.6  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0852652  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0935  phage virion morphogenesis protein  37.16 
 
 
148 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3040  phage virion morphogenesis protein GpS  38 
 
 
150 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425001 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2767  phage virion morphogenesis protein  36.73 
 
 
154 aa  92  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.421355  decreased coverage  0.0000180164 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3039  phage virion morphogenesis protein  35.37 
 
 
148 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000653832 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37490  Phage P2 essential tail completion gpS-like protein  36.67 
 
 
151 aa  91.3  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2856  phage virion morphogenesis protein  35.14 
 
 
149 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4847  phage virion morphogenesis protein  36.91 
 
 
149 aa  89  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0196  phage virion morphogenesis protein  38 
 
 
149 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.067335 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00839  putative phage tail protein  34.69 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00845  hypothetical protein  34.69 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2337  phage virion morphogenesis protein  33.56 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.028961  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3823  phage virion morphogenesis protein  35.96 
 
 
212 aa  63.5  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3650  phage tail completion protein  29.17 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0849986  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3666  phage tail completion protein  29.17 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1936  phage virion morphogenesis family  35.37 
 
 
211 aa  57.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2651  phage virion morphogenesis protein  40.62 
 
 
213 aa  52  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0968065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>