26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3182 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3182  phage virion morphogenesis protein  100 
 
 		 149 aa  302  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0850838  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3489  phage virion morphogenesis protein  61.22 
 
 		 154 aa  185  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4375  phage virion morphogenesis protein  57.05 
 
 		 155 aa  181  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000468393 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2856  phage virion morphogenesis protein  51.35 
 
 		 149 aa  150  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0935  phage virion morphogenesis protein  48.65 
 
 		 148 aa  144  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4335  phage virion morphogenesis protein GpS  46.62 
 
 		 150 aa  144  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.016595 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2767  phage virion morphogenesis protein  48.32 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.421355  decreased coverage  0.0000180164 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3040  phage virion morphogenesis protein GpS  45.27 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425001 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3039  phage virion morphogenesis protein  51.88 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000653832 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00845  hypothetical protein  53.03 
 
 		 148 aa  140  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00839  putative phage tail protein  53.03 
 
 		 148 aa  140  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2337  phage virion morphogenesis protein  46.31 
 
 		 148 aa  136  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.028961  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37490  Phage P2 essential tail completion gpS-like protein  48.65 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1928  tail completion-like protein  43.24 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.789532 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4847  phage virion morphogenesis protein  42.57 
 
 		 149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0196  phage virion morphogenesis protein  42.95 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.067335 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3299  phage virion morphogenesis protein  40.67 
 
 		 155 aa  110  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.546085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01352  phage virion morphogenesis protein  43.24 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.981003  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2905  phage virion morphogenesis protein  41.61 
 
 		 154 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00409372  normal  0.452389 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1389  phage virion morphogenesis (putative tail completion) protein  45.27 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0852652  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1340  phage virion morphogenesis protein  37.66 
 
 		 155 aa  91.7  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3650  phage tail completion protein  38.52 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0849986  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3666  phage tail completion protein  38.52 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3823  phage virion morphogenesis protein  30.5 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2651  phage virion morphogenesis protein  45.35 
 
 		 213 aa  53.9  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0968065  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1936  phage virion morphogenesis family  37.18 
 
 		 211 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>