28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2767 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_2767  phage virion morphogenesis protein  100 
 
 
154 aa  318  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.421355  decreased coverage  0.0000180164 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3039  phage virion morphogenesis protein  87.76 
 
 
148 aa  265  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000653832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0935  phage virion morphogenesis protein  88.36 
 
 
148 aa  263  4e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00839  putative phage tail protein  95.38 
 
 
148 aa  253  5e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00845  hypothetical protein  95.38 
 
 
148 aa  253  5e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2856  phage virion morphogenesis protein  82.55 
 
 
149 aa  249  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2337  phage virion morphogenesis protein  51.37 
 
 
148 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.028961  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3182  phage virion morphogenesis protein  48.32 
 
 
149 aa  142  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0850838  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4847  phage virion morphogenesis protein  49.66 
 
 
149 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0196  phage virion morphogenesis protein  49.65 
 
 
149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.067335 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3489  phage virion morphogenesis protein  43.51 
 
 
154 aa  137  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4375  phage virion morphogenesis protein  42.95 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000468393 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01352  phage virion morphogenesis protein  44.22 
 
 
148 aa  125  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.981003  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37490  Phage P2 essential tail completion gpS-like protein  47.26 
 
 
151 aa  125  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1928  tail completion-like protein  44.78 
 
 
148 aa  120  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  0.789532 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1340  phage virion morphogenesis protein  40.67 
 
 
155 aa  115  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1389  phage virion morphogenesis (putative tail completion) protein  45.58 
 
 
152 aa  108  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0852652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4335  phage virion morphogenesis protein GpS  37.58 
 
 
150 aa  107  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.016595 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3299  phage virion morphogenesis protein  40.43 
 
 
155 aa  106  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.546085  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3040  phage virion morphogenesis protein GpS  37.16 
 
 
150 aa  103  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425001 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2905  phage virion morphogenesis protein  36.73 
 
 
154 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00409372  normal  0.452389 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3666  phage tail completion protein  37.5 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3650  phage tail completion protein  37.5 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0849986  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1936  phage virion morphogenesis family  28.78 
 
 
211 aa  60.5  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3823  phage virion morphogenesis protein  46.15 
 
 
212 aa  58.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2651  phage virion morphogenesis protein  37.8 
 
 
213 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0968065  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0698  putative virion morphogenesis protein  32 
 
 
221 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5058  putative virion morphogenesis protein  31 
 
 
221 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0766452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>