12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_C0012 on replicon NC_010672
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010672  SbBS512_C0012    100 
 
 		 1860 bp  3687    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00713583  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00699  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  100 
 
 		 1266 bp  48.1  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00012175  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2896  protein TolA  100 
 
 		 1266 bp  48.1  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000491333  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2369  TolA family protein  96.43 
 
 		 1023 bp  48.1  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000264795  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0792  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  100 
 
 		 1266 bp  48.1  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000022577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0768  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  100 
 
 		 1299 bp  48.1  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263681  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2916  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  100 
 
 		 1272 bp  48.1  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000145417  normal  0.52602 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0762  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  100 
 
 		 1281 bp  48.1  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000171784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0661  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  100 
 
 		 1188 bp  48.1  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498099  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0842  cell envelope integrity inner membrane protein TolA  100 
 
 		 1275 bp  48.1  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000389137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00688  hypothetical protein  100 
 
 		 1266 bp  48.1  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000128446  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0818  hypothetical protein  90 
 
 		 1872 bp  48.1  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>