14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1380 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1354  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  313  5e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.350585  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1380  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  313  5e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0862  hypothetical protein  80.98 
 
 
164 aa  252  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.316962  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1925  thiW protein  43.12 
 
 
174 aa  111  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341907 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4123  thiW protein  43.12 
 
 
174 aa  110  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2442  thiW protein  49.17 
 
 
171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0147282  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0568  thiW protein  39.46 
 
 
161 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000229686  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2485  thiW protein  39.13 
 
 
171 aa  94  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0937  hypothetical protein  34.18 
 
 
169 aa  83.6  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2789  ThiW  35.21 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.162287  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1712  thiW protein  33.78 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.638559  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0835  hypothetical protein  32.16 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.768016  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0286  thiW protein  40.32 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.427336  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1630  thiW protein  27.15 
 
 
181 aa  46.6  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.492516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>