12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2789 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2789  ThiW  100 
 
 
169 aa  304  4.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.162287  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1925  thiW protein  49.28 
 
 
174 aa  111  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341907 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4123  thiW protein  48.53 
 
 
174 aa  111  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2442  thiW protein  44.36 
 
 
171 aa  97.8  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0147282  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1712  thiW protein  47.76 
 
 
178 aa  97.8  7e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.638559  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1354  hypothetical protein  36.25 
 
 
163 aa  89  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.350585  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1380  hypothetical protein  36.25 
 
 
163 aa  89  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0286  thiW protein  43.51 
 
 
159 aa  85.1  4e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.427336  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0862  hypothetical protein  37.32 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.316962  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0568  thiW protein  37.06 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000229686  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2485  thiW protein  37.93 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1630  thiW protein  34.94 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.492516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>