16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0343 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0343  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  268  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.84343  hitchhiker  0.00208243 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0298  hypothetical protein  65.22 
 
 
131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1519  hypothetical protein  61.97 
 
 
107 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0202167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2967  hypothetical protein  60.56 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179901 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3954  hypothetical protein  52.38 
 
 
104 aa  67.8  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3961  hypothetical protein  52.38 
 
 
104 aa  67.8  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1546  hypothetical protein  53.97 
 
 
83 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0733135  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4345  hypothetical protein  50.82 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.1779  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0258  hypothetical protein  46.77 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.990108  normal  0.0309417 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2379  cell division protein GpsB  32.84 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0300  hypothetical protein  45.16 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0391304 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2453  DivIVA family protein  37.68 
 
 
184 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12114  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2228  DivIVA domain protein  46.88 
 
 
257 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0280  cell division protein GpsB  32.14 
 
 
110 aa  40.8  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000392973  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6222  hypothetical protein  38.81 
 
 
197 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1483  DivIVA family protein  28.33 
 
 
111 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0858714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>