10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1546 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1546  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  167  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0733135  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2967  hypothetical protein  52.17 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179901 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1519  hypothetical protein  52.17 
 
 		 107 aa  62  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0202167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0343  hypothetical protein  53.97 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.84343  hitchhiker  0.00208243 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0298  hypothetical protein  50.79 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3954  hypothetical protein  44.12 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3961  hypothetical protein  44.12 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4345  hypothetical protein  45.45 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.1779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6222  hypothetical protein  40.68 
 
 		 197 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2638  DivIVA domain protein  39.06 
 
 		 266 aa  40.8  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>