20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2563 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2563  mercuric ion transport protein, MerT  100 
 
 
121 aa  229  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2510  mercuric transporter MerT  36.56 
 
 
123 aa  51.2  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0170  mercuric transporter MerT  35.71 
 
 
115 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4314  mercuric transporter MerT  35.29 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02957  MerT mercuric transport protein  31.33 
 
 
115 aa  47  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00162085  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3491  mercuric transporter MerT  31.76 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01411  putative mercuric transport protein  33.33 
 
 
106 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.658716  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4342  putative mercuric transport protein  29.27 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5991  mercury transporter MerT  29.9 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.681838 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1662  Hg2+ uptake ATPase  37.33 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.253887  normal  0.775197 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3157  mercuric transporter MerT  31.91 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.847087  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6345  mercuric ion transport protein MerT  31 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000789879  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6172  putative mercuric transport protein  31 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000473397  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2327  mercuric transporter MerT  26.13 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15475  putative mercuric transport protein  31 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000305934  unclonable  3.76194e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0102  putative mercuric transport protein  31 
 
 
116 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626392  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0799  mercuric transporter MerT  30.68 
 
 
152 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.895967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2340  putative mercuric transport protein  31 
 
 
116 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6497  putative mercuric transport protein  31 
 
 
116 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165506  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1216  putative mercuric transport protein  31 
 
 
116 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>