18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4398 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4398  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  209  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4400  sodium/sulphate symporter  96.3 
 
 		 54 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.370983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4054  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  82.93 
 
 		 247 aa  75.1  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.230238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5373  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  65.38 
 
 		 251 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4149  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  65.38 
 
 		 251 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4452  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  65.38 
 
 		 251 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4358  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  65.38 
 
 		 251 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619919 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4100  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  65.38 
 
 		 251 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.985572  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4067  CDP-diacylglycerol diphosphatase  65.38 
 
 		 251 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03752  hypothetical protein  63.46 
 
 		 251 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03803  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  63.46 
 
 		 251 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4053  sodium/sulphate symporter  76.19 
 
 		 434 aa  66.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7176  sodium/sulphate symporter  64.86 
 
 		 433 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4746  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  51.06 
 
 		 265 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0105  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  40.38 
 
 		 265 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6317  sodium/sulphate symporter  62.16 
 
 		 433 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  hitchhiker  0.00328538 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4057  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  40.38 
 
 		 265 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4074  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  38.46 
 
 		 265 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.030551 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>