24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0616 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0616  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  152  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.474137 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0676  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  152  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0610  hypothetical protein  98.72 
 
 		 78 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0731  hypothetical protein  98.72 
 
 		 78 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0666  hypothetical protein  98.72 
 
 		 78 aa  150  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00263  hypothetical protein  55.13 
 
 		 78 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0355  hypothetical protein  55.13 
 
 		 78 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.936677 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0316  hypothetical protein  55.13 
 
 		 78 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0335  hypothetical protein  55.13 
 
 		 78 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00259  hypothetical protein  55.13 
 
 		 78 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1290  protein YcfR  34.12 
 
 		 85 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1313  hypothetical protein  35.29 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000232038 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1971  protein YcfR  35.29 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.1704  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1328  hypothetical protein  35.29 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000844742 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2155  hypothetical protein  34.12 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000201549 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03098  hypothetical protein  32.18 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4555  protein YcfR  30.68 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.421105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1627  hypothetical protein  34.12 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3538  protein YcfR  31.03 
 
 		 87 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3534  protein YcfR  31.03 
 
 		 87 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.780594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0468  hypothetical protein  31.03 
 
 		 87 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3721  protein YcfR  31.03 
 
 		 87 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3427  protein YcfR  31.03 
 
 		 87 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.928315  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0468  protein of unknown function DUF1471  31.03 
 
 		 87 aa  40  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>