17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0666 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A0666  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  152  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0616  hypothetical protein  98.72 
 
 		 78 aa  150  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.474137 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0676  hypothetical protein  98.72 
 
 		 78 aa  150  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0610  hypothetical protein  97.44 
 
 		 78 aa  150  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0731  hypothetical protein  97.44 
 
 		 78 aa  149  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00263  hypothetical protein  55.13 
 
 		 78 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0355  hypothetical protein  55.13 
 
 		 78 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.936677 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0316  hypothetical protein  55.13 
 
 		 78 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0335  hypothetical protein  55.13 
 
 		 78 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00259  hypothetical protein  55.13 
 
 		 78 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1290  protein YcfR  35.29 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1328  hypothetical protein  36.47 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000844742 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1971  protein YcfR  36.47 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.1704  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1313  hypothetical protein  36.47 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000232038 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2155  hypothetical protein  35.29 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000201549 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1627  hypothetical protein  34.12 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884329  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03098  hypothetical protein  31.03 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>