15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3435 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3435  ABC-type Co2+ transport system permease component-like protein  100 
 
 		 190 aa  370  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.700435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1960  hypothetical protein  43.94 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3140  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  32.16 
 
 		 430 aa  87.8  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00188953  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3499  hypothetical protein  37.28 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.128517  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2094  hypothetical protein  30.1 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0202879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0757  hypothetical protein  29.38 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.321867  normal  0.794251 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1472  hypothetical protein  28.11 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1922  hypothetical protein  29.61 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1191  hypothetical protein  28.78 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000156419  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1366  hypothetical protein  29.21 
 
 		 208 aa  49.3  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1322  hypothetical protein  27.94 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1950  hypothetical protein  27.45 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1132  hypothetical protein  32.67 
 
 		 148 aa  45.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.553572 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0895  hypothetical protein  26.76 
 
 		 289 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169761 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40260  hypothetical protein  34.72 
 
 		 2456 aa  42  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.702086  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>