21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1922 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1922  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  437  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0895  hypothetical protein  48.15 
 
 
289 aa  186  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169761 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1191  hypothetical protein  32.68 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000156419  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1472  hypothetical protein  38.36 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3137  hypothetical protein  36.79 
 
 
202 aa  109  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0757  hypothetical protein  29.61 
 
 
205 aa  99  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.321867  normal  0.794251 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2094  hypothetical protein  29.56 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0202879  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2021  hypothetical protein  32.52 
 
 
232 aa  82  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000158905  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1347  hypothetical protein  34.58 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0331737  hitchhiker  0.0000160464 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3948  putative CbiL protein  30.73 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1366  hypothetical protein  32.06 
 
 
208 aa  64.7  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1322  hypothetical protein  32.24 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3208  putative CbiL protein  29.26 
 
 
197 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3110  hypothetical protein  33.67 
 
 
112 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000231374  normal  0.507258 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1132  hypothetical protein  34.94 
 
 
148 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.553572 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1960  hypothetical protein  30.29 
 
 
210 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3435  ABC-type Co2+ transport system permease component-like protein  27.51 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.700435  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3499  hypothetical protein  25.67 
 
 
175 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.128517  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1950  hypothetical protein  23.42 
 
 
212 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0172  hypothetical protein  28.99 
 
 
138 aa  42.7  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3140  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  25.81 
 
 
430 aa  42.4  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00188953  normal  0.574819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>