19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0424 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0424  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  583  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.907602  normal  0.0687278 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2410  hypothetical protein  84.48 
 
 		 290 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.756599 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0753  Salt-stress induced outer membrane protein  84.48 
 
 		 290 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1551  hypothetical protein  45.42 
 
 		 306 aa  237  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0370  hypothetical protein  25.64 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.397767 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3855  hypothetical protein  24.78 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.248641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2309  protein of unknown function DUF481  24.89 
 
 		 244 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.070466 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3223  hypothetical protein  23.11 
 
 		 255 aa  46.6  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3360  hypothetical protein  23.11 
 
 		 255 aa  46.6  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.853104  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1803  hypothetical protein  23.65 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000450339  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1941  hypothetical protein  23.65 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00616425  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1585  hypothetical protein  21.55 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281784  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1910  hypothetical protein  23.65 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155146  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1469  hypothetical protein  23.65 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0334595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1967  hypothetical protein  23.65 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2440  hypothetical protein  23.65 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.350144  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01691  hypothetical protein  23.33 
 
 		 252 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01679  hypothetical protein  23.33 
 
 		 252 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1920  protein of unknown function DUF481  23.33 
 
 		 252 aa  44.3  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>