14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2376 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2376  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  175  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4905  hypothetical protein  42.5 
 
 		 89 aa  71.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1314  plasmid stabilization system protein  42.05 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60235  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2059  plasmid stabilization system protein  42.05 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0175569  normal  0.0247897 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2757  plasmid stabilization system protein  42.05 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688335 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2829  plasmid stabilization system protein  42.05 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  33.33 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  31.71 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.05 
 
 		 102 aa  42.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  37.97 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5159  plasmid stabilization system protein  32.05 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1116  plasmid stabilization system  35.37 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0746682 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.17 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>