23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1477 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1477  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  494  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5242  hypothetical protein  30.69 
 
 
254 aa  96.7  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.019453  normal  0.202223 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2171  hypothetical protein  37.16 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.3355  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5468  hypothetical protein  30.19 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0698  hypothetical protein  28.74 
 
 
227 aa  60.1  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.658114  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3940  macrocin-O-methyltransferase  31.79 
 
 
301 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.881995  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1291  macrocin-O-methyltransferase  27.27 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1835  putative methyltransferase  29.28 
 
 
258 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1954  putative O-methyltransferase  29.77 
 
 
219 aa  49.7  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  normal  0.0258663 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3453  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  25.76 
 
 
485 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2468  hypothetical protein  26.29 
 
 
281 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2351  macrocin-O-methyltransferase  29.2 
 
 
557 aa  46.6  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4202  hypothetical protein  27.49 
 
 
250 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0529  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  28.57 
 
 
224 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4841  hypothetical protein  24.88 
 
 
268 aa  45.4  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.781008  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2761  hypothetical protein  25.38 
 
 
434 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0539  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  28.02 
 
 
224 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.646153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0551  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  28.02 
 
 
224 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3365  hypothetical protein  27.92 
 
 
246 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.668804  normal  0.0254427 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4080  macrocin O-methyltransferase  22.89 
 
 
281 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.310855  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0930  macrocin-O-methyltransferase  24.36 
 
 
281 aa  42.7  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2419  macrocin-O-methyltransferase  25.79 
 
 
277 aa  42.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1203  putative methyltransferase  29.71 
 
 
266 aa  42  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139767  normal  0.896147 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>