14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1054 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1054  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  872    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3705  hypothetical protein  38.28 
 
 		 417 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5510  hypothetical protein  38.28 
 
 		 417 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1194  hypothetical protein  37.04 
 
 		 450 aa  217  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2793  hypothetical protein  35.13 
 
 		 448 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3646  hypothetical protein  31.08 
 
 		 414 aa  186  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0628456 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2334  hypothetical protein  40.78 
 
 		 141 aa  86.7  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3014  hypothetical protein  41.67 
 
 		 135 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3447  hypothetical protein  34.96 
 
 		 134 aa  82.8  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101233  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3265  hypothetical protein  38.14 
 
 		 135 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.210422 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2722  hypothetical protein  34.23 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000050933  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2395  hypothetical protein  36.27 
 
 		 300 aa  73.2  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.511829  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1912  hypothetical protein  38.68 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1661  hypothetical protein  31.91 
 
 		 132 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00606542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>