15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2722 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2722  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  616  1e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000050933  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1661  hypothetical protein  54.63 
 
 		 132 aa  132  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00606542 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1912  hypothetical protein  46.02 
 
 		 149 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1054  hypothetical protein  34.23 
 
 		 443 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3646  hypothetical protein  27.36 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0628456 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3447  hypothetical protein  35.87 
 
 		 134 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101233  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2334  hypothetical protein  33.04 
 
 		 141 aa  60.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3014  hypothetical protein  34.78 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1194  hypothetical protein  22.58 
 
 		 450 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3265  hypothetical protein  33.7 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.210422 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3705  hypothetical protein  33.33 
 
 		 417 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5510  hypothetical protein  33.33 
 
 		 417 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2395  hypothetical protein  26.45 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.511829  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1553  hypothetical protein  29.89 
 
 		 354 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0280636  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2793  hypothetical protein  24.18 
 
 		 448 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>