18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2535 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2535  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  406  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2121  hypothetical protein  98.51 
 
 		 202 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0946  hypothetical protein  63 
 
 		 208 aa  259  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.604369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2706  hypothetical protein  63.16 
 
 		 206 aa  238  5.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.738523  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4479  hypothetical protein  51.23 
 
 		 210 aa  184  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493191 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2723  hypothetical protein  50.28 
 
 		 223 aa  174  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1400  hypothetical protein  48.6 
 
 		 237 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0061  hypothetical protein  38.64 
 
 		 184 aa  126  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.703498  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3203  hypothetical protein  37.79 
 
 		 183 aa  117  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.69452  normal  0.113194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1706  hypothetical protein  39.41 
 
 		 182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1642  hypothetical protein  35.67 
 
 		 182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.216303 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4709  hypothetical protein  35.09 
 
 		 180 aa  102  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219741  normal  0.0232452 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0666  hypothetical protein  38.4 
 
 		 156 aa  94.4  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5252  putative signal peptide  38.1 
 
 		 182 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.666894  decreased coverage  0.00344159 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2071  hypothetical protein  33.92 
 
 		 174 aa  92  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2929  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  33.15 
 
 		 175 aa  89.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00474238  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3054  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  38.89 
 
 		 176 aa  90.1  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.87189  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0729  hypothetical protein  29.59 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.0621223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>