9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3370 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3370  lipoprotein  100 
 
 		 160 aa  332  9e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3693  putative lipoprotein  95.65 
 
 		 161 aa  290  4e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0056  lipoprotein  77.11 
 
 		 166 aa  244  4.9999999999999997e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.117422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0048  hypothetical protein  57.86 
 
 		 157 aa  176  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0073  lipoprotein  60.29 
 
 		 154 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.339452  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0759  hypothetical protein  53.57 
 
 		 172 aa  172  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00115128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2531  lipoprotein  54.55 
 
 		 169 aa  157  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0233  hypothetical protein  36.21 
 
 		 171 aa  84  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.802967  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0119  hypothetical protein  27.42 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>