9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0119 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0119  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  366  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0233  hypothetical protein  39.02 
 
 		 171 aa  96.7  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.802967  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0073  lipoprotein  30 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.339452  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3370  lipoprotein  27.42 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0048  hypothetical protein  29.06 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3693  putative lipoprotein  28.33 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0056  lipoprotein  27.35 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.117422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2531  lipoprotein  26.23 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0759  hypothetical protein  23.39 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00115128  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>