9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0759 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0759  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  360  5.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00115128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2531  lipoprotein  58.38 
 
 		 169 aa  204  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0073  lipoprotein  67.72 
 
 		 154 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.339452  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0048  hypothetical protein  62.86 
 
 		 157 aa  192  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3370  lipoprotein  57.97 
 
 		 160 aa  167  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0056  lipoprotein  61.98 
 
 		 166 aa  166  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.117422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3693  putative lipoprotein  57.55 
 
 		 161 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0233  hypothetical protein  30.77 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.802967  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0119  hypothetical protein  23.39 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>