15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0898 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0898  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  130  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318072  normal  0.671417 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0827  putative transmembrane protein  97.06 
 
 		 68 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179582  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0974  hypothetical protein  83.82 
 
 		 68 aa  93.6  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0129383  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1660  hypothetical protein  56.52 
 
 		 74 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.98544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5300  hypothetical protein  56.52 
 
 		 74 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0214  hypothetical protein  39.22 
 
 		 80 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.508022 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3439  hypothetical protein  46.81 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.00000000000342472  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4928  hypothetical protein  46.81 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000124086  normal  0.0470528 
 
 
 
NC_010515  Bcenmc03_5359  hypothetical protein  46.81 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208864  normal  0.10332 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2800  Ankyrin  40 
 
 		 457 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0763  hypothetical protein  52.63 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00564104  hitchhiker  0.0000763361 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1984  hypothetical protein  48.84 
 
 		 55 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0130  hypothetical protein  41.07 
 
 		 75 aa  47  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47868  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3932  hypothetical protein  45.65 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.938886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3036  hypothetical protein  42.55 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000373375  normal  0.010036 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>