13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0130 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0130  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  152  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47868  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3439  hypothetical protein  45.45 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.00000000000342472  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4928  hypothetical protein  45.45 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000124086  normal  0.0470528 
 
 
 
NC_010515  Bcenmc03_5359  hypothetical protein  45.45 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208864  normal  0.10332 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0898  hypothetical protein  41.07 
 
 
68 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318072  normal  0.671417 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0827  putative transmembrane protein  39.29 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179582  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1660  hypothetical protein  37.1 
 
 
74 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.98544  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3932  hypothetical protein  43.4 
 
 
88 aa  45.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.938886 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5300  hypothetical protein  37.1 
 
 
74 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470279  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2800  Ankyrin  45.71 
 
 
457 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3036  hypothetical protein  32.88 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000373375  normal  0.010036 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0214  hypothetical protein  36.07 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.508022 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1984  hypothetical protein  51.28 
 
 
55 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>