11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0621 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0621  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.302849 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1164  hypothetical protein  94.24 
 
 		 295 aa  524  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.364262  normal  0.878784 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4474  hypothetical protein  96.95 
 
 		 295 aa  518  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.71086  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2301  hypothetical protein  95.59 
 
 		 295 aa  511  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4473  hypothetical protein  50.19 
 
 		 304 aa  243  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.43412  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2300  hypothetical protein  49.81 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.237935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0622  hypothetical protein  49.81 
 
 		 304 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.892585  normal  0.437771 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1165  hypothetical protein  52.04 
 
 		 224 aa  229  4e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.646579  normal  0.866745 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0409  hypothetical protein  40.51 
 
 		 305 aa  169  6e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.513472 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0135  hypothetical protein  33.33 
 
 		 347 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0137  hypothetical protein  31.58 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>