21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3218 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3218  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  465  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0413627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2704  hypothetical protein  68.86 
 
 		 236 aa  297  9e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1237  hypothetical protein  42.22 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.311054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1011  hypothetical protein  31.71 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000583192 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1129  hypothetical protein  32.12 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1768  hypothetical protein  41 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0532  hypothetical protein  28.19 
 
 		 295 aa  54.7  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.535949  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4842  hypothetical protein  35.58 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0911  hypothetical protein  34.15 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113693 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1320  hypothetical protein  44.74 
 
 		 232 aa  52.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1051  hypothetical protein  30.16 
 
 		 276 aa  49.7  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4313  hypothetical protein  44.12 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2214  hypothetical protein  37.31 
 
 		 186 aa  48.5  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000223654  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1505  hypothetical protein  38.81 
 
 		 183 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233696  normal  0.576417 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2305  hypothetical protein  34.57 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394672  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2970  hypothetical protein  38.36 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0880861  normal  0.286418 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3738  hypothetical protein  37.31 
 
 		 186 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4314  hypothetical protein  35.62 
 
 		 207 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0955  hypothetical protein  26.54 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1940  hypothetical protein  31.25 
 
 		 264 aa  43.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00138193  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1682  hypothetical protein  30.39 
 
 		 179 aa  42.7  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.184535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>