14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1505 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1505  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  365  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233696  normal  0.576417 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3738  hypothetical protein  70.97 
 
 
186 aa  262  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0532  hypothetical protein  41.1 
 
 
295 aa  62.8  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.535949  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0394  hypothetical protein  40 
 
 
201 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.126586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2704  hypothetical protein  31.71 
 
 
236 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0911  hypothetical protein  32.62 
 
 
220 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113693 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2970  hypothetical protein  32.93 
 
 
227 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0880861  normal  0.286418 
 
 
-
 
NC_002936  DET1057  hypothetical protein  33.78 
 
 
185 aa  45.4  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00747978  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3218  hypothetical protein  38.81 
 
 
238 aa  45.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0413627  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2214  hypothetical protein  34.25 
 
 
186 aa  43.9  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000223654  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2305  hypothetical protein  39.39 
 
 
276 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394672  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_925  hypothetical protein  32.43 
 
 
174 aa  42.4  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00989395  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4281  hypothetical protein  30.12 
 
 
409 aa  42  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0936  hypothetical protein  31.08 
 
 
190 aa  40.8  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>