21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4608 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4608  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  244  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2703  hypothetical protein  41.59 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3614  hypothetical protein  34.82 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4453  hypothetical protein  34.82 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3913  hypothetical protein  34.82 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.625508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4670  hypothetical protein  33.93 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.284014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2175  hypothetical protein  34.82 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3291  hypothetical protein  34.68 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386827  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0822  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773892  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0476  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195893  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2369  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1805  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0426  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2508  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0695  hypothetical protein  36.78 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.546911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5305  hypothetical protein  32.48 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0658757 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3807  hypothetical protein  31.67 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.100426  normal  0.926876 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0637  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  42.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497373  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4982  hypothetical protein  31.62 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.315016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3385  hypothetical protein  31.62 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734008  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2526  hypothetical protein  31.52 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.312099  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>