23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1804 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1804  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 267 aa  551  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.130768 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4242  2OG-Fe(II) oxygenase  77.02 
 
 		 269 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3538  2OG-Fe(II) oxygenase  78.97 
 
 		 269 aa  384  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4124  2OG-Fe(II) oxygenase  77.02 
 
 		 269 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4019  2OG-Fe(II) oxygenase  78.97 
 
 		 269 aa  384  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal  0.70334 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4468  2OG-Fe(II) oxygenase  75.73 
 
 		 269 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.342979  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4297  2OG-Fe(II) oxygenase  69.47 
 
 		 270 aa  381  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743423  normal  0.368434 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1911  2OG-Fe(II) oxygenase  76.17 
 
 		 268 aa  381  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3395  2OG-Fe(II) oxygenase  76.6 
 
 		 269 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0625  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  69.85 
 
 		 270 aa  377  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0111909 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3873  2OG-Fe(II) oxygenase  70.87 
 
 		 289 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0524705  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1905  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  75 
 
 		 257 aa  358  5e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2069  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  74.11 
 
 		 283 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105762  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0755  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  74.44 
 
 		 396 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1765  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  74.44 
 
 		 397 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2023  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  74.44 
 
 		 397 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676178  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0694  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  74.11 
 
 		 256 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.467875  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0783  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  74.11 
 
 		 256 aa  353  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1048  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  74.44 
 
 		 397 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0945  hypothetical protein  26.03 
 
 		 259 aa  49.7  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.333132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2315  hypothetical protein  26.32 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15037  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1714  hypothetical protein  24.53 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4656  hypothetical protein  27.73 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>