24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3538 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4019  2OG-Fe(II) oxygenase  99.63 
 
 		 269 aa  553  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.755461  normal  0.70334 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3538  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 269 aa  554  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4468  2OG-Fe(II) oxygenase  92.19 
 
 		 269 aa  493  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.342979  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4242  2OG-Fe(II) oxygenase  94.05 
 
 		 269 aa  494  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4124  2OG-Fe(II) oxygenase  94.42 
 
 		 269 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3395  2OG-Fe(II) oxygenase  94.05 
 
 		 269 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1911  2OG-Fe(II) oxygenase  92.13 
 
 		 268 aa  481  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1905  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  82.83 
 
 		 257 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1804  2OG-Fe(II) oxygenase  78.15 
 
 		 267 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.130768 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1765  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  80.87 
 
 		 397 aa  394  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2023  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  80.87 
 
 		 397 aa  394  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676178  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0694  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  80.69 
 
 		 256 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.467875  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0783  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  80.69 
 
 		 256 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1048  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  80.87 
 
 		 397 aa  394  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0755  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  80.87 
 
 		 396 aa  394  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2069  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  80.69 
 
 		 283 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105762  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3873  2OG-Fe(II) oxygenase  73.52 
 
 		 289 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0524705  normal  0.85637 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4297  2OG-Fe(II) oxygenase  69.81 
 
 		 270 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743423  normal  0.368434 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0625  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  74.58 
 
 		 270 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0111909 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1714  hypothetical protein  23.15 
 
 		 254 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0945  hypothetical protein  25.16 
 
 		 259 aa  48.9  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.333132  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1260  hypothetical protein  27.4 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.503524  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2315  hypothetical protein  24.38 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1346  hypothetical protein  25 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0182912  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>