More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0486 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_0486  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  100 
 
 
159 aa  323  7e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0540  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  91.72 
 
 
161 aa  294  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0468  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  83.54 
 
 
158 aa  272  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.802085  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0481  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  80.25 
 
 
158 aa  262  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0560  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  79.62 
 
 
158 aa  259  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73481  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0449  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  73.89 
 
 
158 aa  244  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0687758  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0679  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  72.78 
 
 
158 aa  241  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255397  normal  0.166188 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3287  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  70.89 
 
 
158 aa  239  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1824  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  72.26 
 
 
158 aa  237  5.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.449242  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0660  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  71.7 
 
 
159 aa  236  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5969  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  70.7 
 
 
162 aa  233  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.126109 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2027  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  70.7 
 
 
162 aa  233  7e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2638  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  70.7 
 
 
162 aa  233  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2685  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  70.7 
 
 
162 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2667  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  70.06 
 
 
162 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2558  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  70.06 
 
 
162 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3090  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  70.78 
 
 
160 aa  224  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2793  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  71.79 
 
 
162 aa  223  6e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0199  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  67.72 
 
 
161 aa  223  8e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547935 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4040  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  66.67 
 
 
163 aa  221  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0984  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  67.31 
 
 
164 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.86869  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0826  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  67.31 
 
 
164 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0816544  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4677  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  68.83 
 
 
162 aa  219  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4671  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  67.74 
 
 
161 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.921283 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0026  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  67.53 
 
 
168 aa  218  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320012  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0822  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  66.67 
 
 
164 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0653  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  66.67 
 
 
164 aa  216  7.999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5177  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  67.92 
 
 
163 aa  215  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4034  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  66.67 
 
 
161 aa  214  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2950  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  66.45 
 
 
161 aa  213  8e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.684594  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0861  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  67.11 
 
 
156 aa  213  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.274108 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3384  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  67.55 
 
 
163 aa  210  5.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3920  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  62.28 
 
 
173 aa  208  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000593199 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0569  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  65.81 
 
 
159 aa  207  7e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.310485  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0062  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  70.51 
 
 
171 aa  205  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0515653 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4038  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  63.75 
 
 
166 aa  202  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0491  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  71.33 
 
 
144 aa  202  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037276 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0390  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  60.87 
 
 
179 aa  201  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2482  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  63.69 
 
 
163 aa  199  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2730  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  63.23 
 
 
167 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0869107  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0590  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  61.29 
 
 
159 aa  188  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0834  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  60.78 
 
 
277 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0276229  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2027  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  59.87 
 
 
157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2568  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  60 
 
 
161 aa  180  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.309138  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1265  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  56.49 
 
 
171 aa  180  8.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999034  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2000  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  58.49 
 
 
159 aa  179  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0709  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  58.49 
 
 
159 aa  179  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.551148 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3096  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  59.87 
 
 
159 aa  178  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2957  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  58.71 
 
 
166 aa  178  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1101  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  58.06 
 
 
165 aa  177  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3176  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  55.13 
 
 
160 aa  177  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188759  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2340  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  53.9 
 
 
158 aa  177  7e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2078  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  57.89 
 
 
262 aa  176  8e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00767498  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1321  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  57.89 
 
 
165 aa  176  9e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.133963  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5213  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  56.41 
 
 
161 aa  176  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.950131  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1410  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  57.89 
 
 
164 aa  176  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.199547 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5136  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  56.41 
 
 
161 aa  175  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.056624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4673  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  56.41 
 
 
161 aa  175  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1691  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  55.19 
 
 
161 aa  175  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1142  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  57.42 
 
 
165 aa  175  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0543  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  57.69 
 
 
158 aa  175  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4373  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  57.32 
 
 
162 aa  174  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2052  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  53.25 
 
 
158 aa  174  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1823  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  58.55 
 
 
165 aa  174  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213246 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2267  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  56.69 
 
 
164 aa  174  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2440  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  54.78 
 
 
160 aa  174  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5577  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  57.32 
 
 
160 aa  173  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.406561  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2842  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  54.84 
 
 
165 aa  173  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1275  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  57.96 
 
 
161 aa  172  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0549664  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1801  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  56.05 
 
 
158 aa  172  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000165783  normal  0.139007 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2047  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  56.69 
 
 
158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2134  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  56.21 
 
 
167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1640  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  54.55 
 
 
172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2799  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  57.59 
 
 
173 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.690027  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1137  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  57.42 
 
 
156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.930073 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0060  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  54.78 
 
 
156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199942  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3237  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  58.23 
 
 
176 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4557  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  55.92 
 
 
156 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.757593 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1859  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  52.6 
 
 
157 aa  170  6.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2018  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  57.24 
 
 
165 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00572377  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1893  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  55.48 
 
 
170 aa  170  7.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0320882  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1439  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  49.68 
 
 
162 aa  169  1e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2813  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  56.49 
 
 
166 aa  169  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.492108  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03890  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  53.42 
 
 
166 aa  169  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.25938 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0502  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  56.49 
 
 
175 aa  168  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2762  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  54.19 
 
 
160 aa  169  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.2507599999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2465  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  57.05 
 
 
190 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0297727  normal  0.424983 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1732  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  57.42 
 
 
171 aa  168  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2561  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  55.92 
 
 
169 aa  168  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.418767  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1292  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  55.26 
 
 
156 aa  168  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0827977  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1034  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  56.58 
 
 
158 aa  168  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.846574 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0500  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  53.29 
 
 
159 aa  168  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000463741  hitchhiker  0.0000429916 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2191  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  55.92 
 
 
169 aa  168  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.061752  hitchhiker  0.000000223607 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4433  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  55.26 
 
 
195 aa  167  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.735221 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1839  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  56.77 
 
 
169 aa  167  6e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2608  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  51.95 
 
 
160 aa  167  6e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.627157  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2079  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  55.41 
 
 
160 aa  167  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380607  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5872  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  51.9 
 
 
159 aa  167  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259043  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0899  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  54.61 
 
 
156 aa  167  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.045241  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1479  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  53.95 
 
 
163 aa  167  7e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>