More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2685 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_2685  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  100 
 
 
162 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2558  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  99.38 
 
 
162 aa  323  5e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5969  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  98.15 
 
 
162 aa  320  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.126109 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2027  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  96.3 
 
 
162 aa  313  6e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2638  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  96.3 
 
 
162 aa  313  6e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2667  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  95.68 
 
 
162 aa  312  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0660  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  95.57 
 
 
159 aa  306  6.999999999999999e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0653  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  90.51 
 
 
164 aa  290  6e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0826  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  89.87 
 
 
164 aa  288  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0816544  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0984  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  89.87 
 
 
164 aa  288  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.86869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0822  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  89.24 
 
 
164 aa  287  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3287  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  86.62 
 
 
158 aa  276  6e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0679  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  85.35 
 
 
158 aa  275  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255397  normal  0.166188 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0449  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  84.81 
 
 
158 aa  271  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0687758  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0026  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  87.66 
 
 
168 aa  270  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320012  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0481  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  75.32 
 
 
158 aa  245  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0468  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  75.8 
 
 
158 aa  242  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.802085  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0560  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  75.32 
 
 
158 aa  239  7.999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73481  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0486  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  70.7 
 
 
159 aa  232  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0199  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  68.12 
 
 
161 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547935 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0540  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  70.32 
 
 
161 aa  227  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2793  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  69.23 
 
 
162 aa  224  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0491  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  76.39 
 
 
144 aa  221  4e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037276 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3090  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  69.68 
 
 
160 aa  218  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4677  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  73.03 
 
 
162 aa  218  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5177  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  69.38 
 
 
163 aa  216  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4040  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  67.3 
 
 
163 aa  214  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4034  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  70.51 
 
 
161 aa  214  5e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0861  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  68.59 
 
 
156 aa  212  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.274108 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4038  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  67.08 
 
 
166 aa  212  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4671  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  68.18 
 
 
161 aa  211  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.921283 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1824  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  64.74 
 
 
158 aa  209  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.449242  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3384  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  70.2 
 
 
163 aa  207  6e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0390  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  66.67 
 
 
179 aa  207  6e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2482  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  65.43 
 
 
163 aa  203  8e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3920  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  62.65 
 
 
173 aa  202  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000593199 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1801  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  63.29 
 
 
158 aa  198  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000165783  normal  0.139007 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0569  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  62.26 
 
 
159 aa  198  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.310485  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0062  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  68.32 
 
 
171 aa  198  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0515653 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2568  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  65.38 
 
 
161 aa  197  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.309138  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2950  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  61.94 
 
 
161 aa  197  7e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.684594  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0709  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  62.42 
 
 
159 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.551148 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2000  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  62.42 
 
 
159 aa  194  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2027  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  63.52 
 
 
157 aa  193  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2730  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  61.54 
 
 
167 aa  191  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0869107  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1101  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  61.73 
 
 
165 aa  192  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1640  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  60.76 
 
 
172 aa  190  6e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1142  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  61.11 
 
 
165 aa  189  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3096  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  61.78 
 
 
159 aa  189  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2047  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  62.42 
 
 
158 aa  189  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1410  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  60 
 
 
164 aa  186  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.199547 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1823  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  61.69 
 
 
165 aa  185  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5577  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  61.39 
 
 
160 aa  184  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.406561  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0502  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  60.13 
 
 
175 aa  183  8e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4373  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  59.49 
 
 
162 aa  182  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2018  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  60.39 
 
 
165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00572377  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1732  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  58.6 
 
 
171 aa  181  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.498011  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2078  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  60.13 
 
 
262 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00767498  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1137  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  62.34 
 
 
156 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.930073 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5136  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  59.12 
 
 
161 aa  180  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.056624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4673  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  59.12 
 
 
161 aa  180  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1839  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  57.59 
 
 
169 aa  180  8.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0590  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  59.87 
 
 
159 aa  180  8.000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2465  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  60.53 
 
 
190 aa  180  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0297727  normal  0.424983 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5213  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  59.75 
 
 
161 aa  179  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.950131  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1691  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  53.85 
 
 
161 aa  179  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  60.39 
 
 
157 aa  177  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275685  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2813  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  60.26 
 
 
166 aa  176  9e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.492108  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03890  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  56.36 
 
 
166 aa  176  9e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.25938 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3098  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  60.26 
 
 
163 aa  176  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1859  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  55.63 
 
 
157 aa  174  5e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2608  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  56.49 
 
 
160 aa  174  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.627157  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1321  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  55.97 
 
 
165 aa  173  7e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.133963  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1034  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  59.38 
 
 
158 aa  173  8e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.846574 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0834  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  60.13 
 
 
277 aa  172  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0276229  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4484  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  59.74 
 
 
163 aa  173  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5393  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  60.13 
 
 
160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60322  normal  0.290972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0543  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  58.71 
 
 
158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2842  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  56.36 
 
 
165 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1292  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  58.6 
 
 
156 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0827977  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3176  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  57.42 
 
 
160 aa  170  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188759  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4461  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  56.6 
 
 
162 aa  170  6.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2079  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  56.86 
 
 
160 aa  169  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380607  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1265  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  56.49 
 
 
171 aa  169  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999034  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3399  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  53.9 
 
 
168 aa  169  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00462451  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2267  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  55.62 
 
 
164 aa  168  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2157  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  52.53 
 
 
166 aa  169  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0732245  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4433  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  58.6 
 
 
195 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.735221 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4636  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  54.14 
 
 
175 aa  168  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1417  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  56.33 
 
 
160 aa  168  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5872  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  55.77 
 
 
159 aa  168  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259043  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4557  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  56.77 
 
 
156 aa  168  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.757593 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3237  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  57.42 
 
 
176 aa  168  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1275  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  56.96 
 
 
161 aa  167  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0549664  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1854  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  55.77 
 
 
163 aa  167  7e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0899  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  56.13 
 
 
156 aa  167  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.045241  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2340  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  51.63 
 
 
158 aa  167  7e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1878  molybdenum cofactor biosynthesis protein MoaC  55.06 
 
 
159 aa  166  9e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4860  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  57.52 
 
 
164 aa  166  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1247  molybdenum cofactor biosynthesis protein C  56.96 
 
 
161 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>