20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0443 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0443  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  188  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.710341  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0262  hypothetical protein  47.5 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0133  hypothetical protein  35.63 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.184177  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0084  hypothetical protein  31.03 
 
 		 96 aa  57  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.314565  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09603  hypothetical protein  31.11 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0576  protein of unknown function DUF493  33.72 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.450406  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2593  hypothetical protein  35.44 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00140819  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1163  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3154  hypothetical protein  34.52 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000128266  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0986  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105204  normal  0.0165558 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2874  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000389579  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0990  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000075069  normal  0.687839 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1051  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000671726  hitchhiker  0.00478592 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3490  hypothetical protein  32.14 
 
 		 88 aa  42.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000408093 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3713  hypothetical protein  32.14 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000213543  hitchhiker  0.00129495 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2940  hypothetical protein  34.52 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000039404  normal  0.0192635 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3322  hypothetical protein  30.95 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000559481  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3458  hypothetical protein  30.95 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00375963  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1087  hypothetical protein  30.95 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000786654  hitchhiker  0.0000064685 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3280  hypothetical protein  30.95 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000870695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>