28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0576 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0576  protein of unknown function DUF493  100 
 
 		 94 aa  194  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.450406  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0107  hypothetical protein  35.63 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0178  hypothetical protein  32.91 
 
 		 92 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3028  hypothetical protein  30.38 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0443  hypothetical protein  33.72 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.710341  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1163  hypothetical protein  28.74 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2874  hypothetical protein  25.88 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000389579  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3713  hypothetical protein  29.89 
 
 		 88 aa  47.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000213543  hitchhiker  0.00129495 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1051  hypothetical protein  28.74 
 
 		 88 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000671726  hitchhiker  0.00478592 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0990  hypothetical protein  28.74 
 
 		 88 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000075069  normal  0.687839 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0986  hypothetical protein  28.74 
 
 		 88 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000105204  normal  0.0165558 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2499  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3490  hypothetical protein  28.74 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000408093 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2593  hypothetical protein  27.85 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00140819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3280  hypothetical protein  25.88 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000870695  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0317  hypothetical protein  27.06 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.125842  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3322  hypothetical protein  25.88 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000559481  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3458  hypothetical protein  25.88 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00375963  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1265  protein of unknown function DUF493  29.73 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0383916  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1087  hypothetical protein  25.88 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000786654  hitchhiker  0.0000064685 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3154  hypothetical protein  27.59 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000128266  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1555  hypothetical protein  31.51 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000623107  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1711  hypothetical protein  29.89 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.654442  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0981  hypothetical protein  28.24 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35106  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0469  hypothetical protein  28.24 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000304752  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0694  hypothetical protein  30.38 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2705  hypothetical protein  25 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0213  hypothetical protein  29.73 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>