16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7016 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_7016  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  184  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3377  hypothetical protein  44.44 
 
 		 73 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0850  hypothetical protein  38.57 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.176173  decreased coverage  0.000187412 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0787  hypothetical protein  43.06 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.18503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0078  hypothetical protein  36.11 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3589  hypothetical protein  38.03 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3879  hypothetical protein  36.99 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0781  hypothetical protein  38.67 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.93563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0072  hypothetical protein  38.89 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3013  hypothetical protein  35.21 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1582  hypothetical protein  45.16 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.13435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1861  hypothetical protein  45.16 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.319136 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5877  hypothetical protein  32.39 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.237548 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5597  hypothetical protein  34.21 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000927603 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6895  hypothetical protein  34.21 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.693773 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1921  hypothetical protein  34.21 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174577 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>