21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3589 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3589  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  167  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3879  hypothetical protein  98.75 
 
 		 83 aa  164  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.79648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5877  hypothetical protein  65.43 
 
 		 82 aa  121  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.237548 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0078  hypothetical protein  55 
 
 		 84 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3013  hypothetical protein  54.05 
 
 		 85 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0072  hypothetical protein  47.44 
 
 		 80 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5177  hypothetical protein  43.59 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3831  hypothetical protein  47.3 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0174  hypothetical protein  45.33 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2945  hypothetical protein  41.33 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0747412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2687  hypothetical protein  41.33 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1879  hypothetical protein  42.17 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1921  hypothetical protein  36.99 
 
 		 77 aa  47  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174577 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7016  hypothetical protein  38.03 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.148967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3600  hypothetical protein  36 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870301 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0370  hypothetical protein  35.38 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5289  hypothetical protein  42.03 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.726061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1861  hypothetical protein  54.29 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.319136 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1582  hypothetical protein  54.29 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.13435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4442  hypothetical protein  37.31 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128261 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0846  hypothetical protein  41.54 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.92161  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>