41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4711 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4711  nitrile hydratase, alpha subunit  100 
 
 
205 aa  417  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.936595 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6981  nitrile hydratase, alpha subunit  88.78 
 
 
205 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.831814  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3460  nitrile hydratase, alpha subunit  80.98 
 
 
205 aa  344  6e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5089  nitrile hydratase, alpha subunit  75.12 
 
 
207 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0661351  normal  0.0749431 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1011  nitrile hydratase, alpha subunit  68.32 
 
 
206 aa  293  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5825  nitrile hydratase, alpha subunit  67.82 
 
 
206 aa  291  5e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.938753  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2748  nitrile hydratase, alpha subunit  54.01 
 
 
209 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618149 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2785  nitrile hydratase, alpha subunit  53.54 
 
 
217 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0466323  normal  0.468653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2746  nitrile hydratase, alpha subunit  54.01 
 
 
241 aa  224  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0904  nitrile hydratase, alpha subunit  54.79 
 
 
219 aa  223  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.782004  normal  0.179131 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2526  nitrile hydratase, alpha subunit  56.45 
 
 
231 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3145  nitrile hydratase, alpha subunit  52.91 
 
 
212 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14169  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4085  nitrile hydratase subunit alpha (Nitrilase) (NHase)  53.23 
 
 
210 aa  222  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0750595 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2704  nitrile hydratase, alpha subunit  53.23 
 
 
216 aa  221  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.323212  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7674  nitrile hydratase, alpha subunit  51.26 
 
 
209 aa  221  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323332  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1665  nitrile hydratase, alpha subunit  52.66 
 
 
208 aa  219  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2001  nitrile hydratase, alpha subunit  53.81 
 
 
213 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.82609  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6960  nitrile hydratase, alpha subunit  54.35 
 
 
211 aa  218  7e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0648  nitrile hydratase, alpha subunit  50.53 
 
 
198 aa  212  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1972  nitrile hydratase, alpha subunit  50.53 
 
 
208 aa  210  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.152581 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7181  nitrile hydratase, alpha subunit  49.2 
 
 
224 aa  205  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.423828  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2315  nitrile hydratase, alpha subunit  50.79 
 
 
207 aa  195  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2330  Nitrile hydratase  48.91 
 
 
197 aa  186  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4284  nitrile hydratase, alpha subunit  46.52 
 
 
199 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.440192  normal  0.649123 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4082  nitrile hydratase, alpha subunit  46.52 
 
 
199 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3233  nitrile hydratase, alpha subunit  46.52 
 
 
199 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.609067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2728  nitrile hydratase, alpha subunit  44.68 
 
 
193 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3787  Nitrile hydratase alpha chain  49.73 
 
 
218 aa  174  6e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.147966 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6544  nitrile hydratase, alpha subunit  44.68 
 
 
199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731828  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6258  nitrile hydratase, alpha subunit  44.15 
 
 
199 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.743744  normal  0.604808 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1849  nitrile hydratse subunit alpha  49.16 
 
 
203 aa  171  5e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.59953 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1540  Nitrile hydratase  49.16 
 
 
215 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.236105  normal  0.091272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2111  nitrile hydratase, alpha subunit  42.02 
 
 
199 aa  168  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4230  Thiocyanate hydrolase  43.01 
 
 
253 aa  158  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1219  hypothetical protein  41.49 
 
 
222 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1077  nitrile hydratase  43.3 
 
 
192 aa  154  6e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.080892  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5258  thiocyanate hydrolase  41.49 
 
 
235 aa  147  9e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5637  thiocyanate hydrolase  41.49 
 
 
235 aa  147  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273063  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5347  thiocyanate hydrolase  41.49 
 
 
220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4916  thiocyanate hydrolase  39.89 
 
 
238 aa  146  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208617  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1504  thiocyanate hydrolase  39.36 
 
 
234 aa  141  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.267475 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>