19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3636 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3636  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  244  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3959  hypothetical protein  77.69 
 
 
117 aa  190  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.281179  normal  0.0264743 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0730  hypothetical protein  76 
 
 
115 aa  151  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2264  conserved hypothetical conserved membrane protein  65.79 
 
 
123 aa  142  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.153108  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2429  hypothetical protein  61.95 
 
 
118 aa  137  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0250  hypothetical protein  64.46 
 
 
128 aa  134  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00978693 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5126  hypothetical protein  77 
 
 
104 aa  131  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02124  hypothetical protein  66.36 
 
 
112 aa  130  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2590  conserved hypothetical conserved membrane protein  62.93 
 
 
121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585354  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2478  hypothetical protein  57.14 
 
 
124 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7358  small integral membrane protein  66.99 
 
 
113 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.585569 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6213  small integral membrane protein  61.98 
 
 
113 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5940  small integral membrane protein  61.98 
 
 
113 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4876  hypothetical protein  58.68 
 
 
115 aa  120  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0975253 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3799  hypothetical protein  58.68 
 
 
115 aa  120  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3894  cytochrome c oxidase subunit IV  63.16 
 
 
109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.798918  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2362  cytochrome c oxidase subunit IV  64.21 
 
 
110 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2341  cytochrome c oxidase, subunit IV  49.04 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3465  hypothetical protein  27 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0320908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>