23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3894 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3894  cytochrome c oxidase subunit IV  100 
 
 		 109 aa  218  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.798918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2362  cytochrome c oxidase subunit IV  85.42 
 
 		 110 aa  166  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2264  conserved hypothetical conserved membrane protein  63.55 
 
 		 123 aa  141  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.153108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2478  hypothetical protein  63.73 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2429  hypothetical protein  65.42 
 
 		 118 aa  140  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0730  hypothetical protein  65.31 
 
 		 115 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2590  conserved hypothetical conserved membrane protein  66 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3959  hypothetical protein  62.38 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.281179  normal  0.0264743 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3636  hypothetical protein  63.16 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.678182  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5126  hypothetical protein  59.41 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3799  hypothetical protein  56.44 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02124  hypothetical protein  53.92 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4876  hypothetical protein  56.44 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0975253 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7358  small integral membrane protein  55.32 
 
 		 113 aa  107  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.585569 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5940  small integral membrane protein  57.45 
 
 		 113 aa  99.4  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6213  small integral membrane protein  57.45 
 
 		 113 aa  99.4  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0250  hypothetical protein  62.77 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00978693 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2341  cytochrome c oxidase, subunit IV  46.36 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5676  hypothetical protein  36.14 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.967687 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0858  caa(3)-type oxidase, subunit IV  31.73 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0854  caa(3)-type oxidase, subunit IV  31.73 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0806  Caa(3)-type oxidase, subunit IV  32.35 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3465  hypothetical protein  40.35 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0320908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>