13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1161 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1161  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4413  hypothetical protein  36 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.937751 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4546  hypothetical protein  36 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0051838 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1232  hypothetical protein  31.2 
 
 		 163 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.258059  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1166  hypothetical protein  27.54 
 
 		 192 aa  51.6  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4398  hypothetical protein  34.74 
 
 		 221 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4531  hypothetical protein  34.74 
 
 		 221 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.674872  normal  0.0487263 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1308  hypothetical protein  30.48 
 
 		 284 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5871  hypothetical protein  29.91 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.652462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1891  putative signal peptide exported protein  30.08 
 
 		 158 aa  41.2  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460761  normal  0.629305 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0055  hypothetical protein  26.87 
 
 		 159 aa  41.2  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.705934  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1556  hypothetical protein  26.87 
 
 		 159 aa  41.2  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1468  hypothetical protein  26.87 
 
 		 159 aa  41.2  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>