12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2966 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2966  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  601  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000140905 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3109  hypothetical protein  73.36 
 
 
299 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.690645  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0480  hypothetical protein  43.07 
 
 
293 aa  198  9e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.369084 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2650  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 
306 aa  151  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1017  hypothetical protein  31.67 
 
 
300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2519  transglutaminase domain protein  34.26 
 
 
278 aa  124  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0270183  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0914  hypothetical protein  35.38 
 
 
213 aa  120  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0361  transglutaminase domain protein  36.84 
 
 
274 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.544765 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1630  transglutaminase domain protein  32.23 
 
 
324 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1742  normal  0.553309 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0784  transglutaminase domain protein  30.04 
 
 
286 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1975  transglutaminase domain protein  30.6 
 
 
297 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000288031  unclonable  0.0000000394362 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3251  hypothetical protein  22.98 
 
 
311 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>