16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0784 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0784  transglutaminase domain protein  100 
 
 
286 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0480  hypothetical protein  37.16 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.369084 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1630  transglutaminase domain protein  34.8 
 
 
324 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1742  normal  0.553309 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3109  hypothetical protein  34.09 
 
 
299 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.690645  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2966  hypothetical protein  30.04 
 
 
298 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000140905 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1017  hypothetical protein  28.24 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0361  transglutaminase domain protein  36.53 
 
 
274 aa  92.8  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.544765 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2519  transglutaminase domain protein  36.03 
 
 
278 aa  90.5  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0270183  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2650  transglutaminase domain protein  29.82 
 
 
306 aa  89.7  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1975  transglutaminase domain protein  30.45 
 
 
297 aa  88.6  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000288031  unclonable  0.0000000394362 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0914  hypothetical protein  32.64 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0103  transglutaminase domain protein  34.21 
 
 
343 aa  48.9  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  32.65 
 
 
266 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  32.65 
 
 
266 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  30 
 
 
298 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  26.39 
 
 
257 aa  42.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>