17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1261 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1261  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  325  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0508  hypothetical protein  77.92 
 
 
160 aa  233  6e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0205  protein of unknown function DUF402  42.48 
 
 
154 aa  133  8e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5529  protein of unknown function DUF402  40.94 
 
 
187 aa  124  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0411  hypothetical protein  34.88 
 
 
177 aa  48.1  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0421  hypothetical protein  29.91 
 
 
177 aa  44.3  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1696  hypothetical protein  28.32 
 
 
184 aa  42.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0443  hypothetical protein  32.43 
 
 
176 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4794  hypothetical protein  32.43 
 
 
176 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0271924  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0434  hypothetical protein  32.43 
 
 
176 aa  42  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0583  hypothetical protein  32.43 
 
 
176 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0531  hypothetical protein  35.06 
 
 
176 aa  42  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.408339  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0510  hypothetical protein  32.43 
 
 
176 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0438  hypothetical protein  32.43 
 
 
176 aa  42  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0941182  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0582  hypothetical protein  32.43 
 
 
176 aa  42  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1055  hypothetical protein  31.46 
 
 
176 aa  41.6  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.195641  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0449  hypothetical protein  32.43 
 
 
176 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>