28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2492 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0434  Ser/Thr protein phosphatase family protein  65.6 
 
 		 491 aa  661    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2352  metallophosphoesterase  86.37 
 
 		 499 aa  817    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.978638  normal  0.379093 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2755  metallophosphoesterase  85.71 
 
 		 504 aa  811    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.497038  normal  0.385672 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4042  metallophosphoesterase  64.74 
 
 		 487 aa  660    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3363  metallophosphoesterase  69.5 
 
 		 487 aa  665    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4433  metallophosphoesterase  69.49 
 
 		 487 aa  660    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.170885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1891  Ser/Thr protein phosphatase family protein  69.65 
 
 		 478 aa  674    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1393  Ser/Thr protein phosphatase family protein  65.6 
 
 		 515 aa  660    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1804  Ser/Thr protein phosphatase family protein  66 
 
 		 514 aa  664    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233212  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0549  Ser/Thr protein phosphatase family protein  69.87 
 
 		 486 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754197  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1889  Ser/Thr protein phosphatase family protein  65.8 
 
 		 514 aa  663    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0922  Ser/Thr protein phosphatase family protein  69.65 
 
 		 486 aa  674    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.952434  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0211  Ser/Thr protein phosphatase family protein  67.08 
 
 		 570 aa  662    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2492  hypothetical protein  100 
 
 		 502 aa  1016    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4153  metallophosphoesterase  69.06 
 
 		 487 aa  658    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.057162  hitchhiker  0.00869758 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3561  metallophosphoesterase  64.65 
 
 		 487 aa  662    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.918692 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4213  metallophosphoesterase  69.06 
 
 		 487 aa  658    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5304  metallophosphoesterase  69.15 
 
 		 509 aa  657    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0741593 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1093  Ser/Thr protein phosphatase family protein  67.62 
 
 		 492 aa  672    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.352094  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1877  metallophosphoesterase  65.86 
 
 		 487 aa  661    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.566467  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1947  Ser/Thr protein phosphatase family protein  69.65 
 
 		 486 aa  668    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0352  Ser/Thr protein phosphatase family protein  67.49 
 
 		 556 aa  666    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0946  Ser/Thr protein phosphatase family protein  65.6 
 
 		 491 aa  661    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0553  Ser/Thr protein phosphatase family protein  69.65 
 
 		 486 aa  674    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0053942  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5147  metallophosphoesterase  38.21 
 
 		 429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0964  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  29.43 
 
 		 430 aa  171  2e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0158  metallophosphoesterase  27.6 
 
 		 431 aa  167  4e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.000210042  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0824  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.6 
 
 		 427 aa  91.3  4e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>