28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2352 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0434  Ser/Thr protein phosphatase family protein  67.55 
 
 
491 aa  670    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2352  metallophosphoesterase  100 
 
 
499 aa  1014    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.978638  normal  0.379093 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2755  metallophosphoesterase  98 
 
 
504 aa  920    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.497038  normal  0.385672 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4042  metallophosphoesterase  64.33 
 
 
487 aa  667    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3363  metallophosphoesterase  68.85 
 
 
487 aa  670    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627152  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4433  metallophosphoesterase  69.71 
 
 
487 aa  668    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.170885  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1891  Ser/Thr protein phosphatase family protein  69 
 
 
478 aa  679    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1393  Ser/Thr protein phosphatase family protein  67.55 
 
 
515 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1804  Ser/Thr protein phosphatase family protein  67.76 
 
 
514 aa  673    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233212  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0549  Ser/Thr protein phosphatase family protein  69.21 
 
 
486 aa  680    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754197  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1889  Ser/Thr protein phosphatase family protein  67.55 
 
 
514 aa  672    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0922  Ser/Thr protein phosphatase family protein  69 
 
 
486 aa  680    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.952434  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0211  Ser/Thr protein phosphatase family protein  67.55 
 
 
570 aa  672    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2492  hypothetical protein  86.37 
 
 
502 aa  788    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4153  metallophosphoesterase  68.41 
 
 
487 aa  665    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.057162  hitchhiker  0.00869758 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3561  metallophosphoesterase  64.33 
 
 
487 aa  667    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.918692 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4213  metallophosphoesterase  68.41 
 
 
487 aa  665    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5304  metallophosphoesterase  65.23 
 
 
509 aa  678    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0741593 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1093  Ser/Thr protein phosphatase family protein  66.47 
 
 
492 aa  681    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.352094  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1877  metallophosphoesterase  64.39 
 
 
487 aa  660    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.566467  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1947  Ser/Thr protein phosphatase family protein  68.78 
 
 
486 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0352  Ser/Thr protein phosphatase family protein  67.76 
 
 
556 aa  675    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0946  Ser/Thr protein phosphatase family protein  67.55 
 
 
491 aa  670    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0553  Ser/Thr protein phosphatase family protein  69 
 
 
486 aa  680    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0053942  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5147  metallophosphoesterase  39.52 
 
 
429 aa  256  9e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0964  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  27.99 
 
 
430 aa  157  3e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0158  metallophosphoesterase  26.92 
 
 
431 aa  155  2e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.000210042  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0824  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.41 
 
 
427 aa  93.2  1e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>