12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0836 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0836  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  428  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3234  hypothetical protein  60 
 
 		 215 aa  248  4e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2644  hypothetical protein  58.41 
 
 		 208 aa  245  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.955298  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3225  hypothetical protein  57.35 
 
 		 207 aa  234  5.0000000000000005e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.212697  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2847  hypothetical protein  49.52 
 
 		 214 aa  210  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.238163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1298  hypothetical protein  50 
 
 		 214 aa  208  4e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2607  hypothetical protein  57.5 
 
 		 212 aa  203  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.648513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2655  hypothetical protein  55.83 
 
 		 215 aa  202  4e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.347171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2771  hypothetical protein  54.82 
 
 		 213 aa  200  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572753 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1234  hypothetical protein  53.61 
 
 		 213 aa  196  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130941 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2076  hypothetical protein  53.01 
 
 		 214 aa  196  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.193183  normal  0.126066 
 
 
-
 
NC_002978  WD0585  hypothetical protein  38.36 
 
 		 166 aa  121  7e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00891026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>